《算法统宗》一书总的编排，仍旧是按照《九章算术》的形式，全书共17卷。

在中国古代数学的整个发展过程中，《算法统宗》是一部十分重要的著作。从流传的长久、广泛和深入来讲，那是任何其他数学著作不能与它相比的。公元1716年（清康熙55年），程家的后代子孙在《算法统宗》新刻本的序言中写道：自《算法统宗》一书于明万历壬辰（公元1592年）问世以后，“风行宇内，近今盖己百有数十余年。海内握算持筹之士，莫不家藏一编，若业制举者（考科举的人）之于四子书、五经义，翁然奉以为宗。”这并不是故作吹嘘之辞。

《算法统宗》的编成及其广泛流传，标志着由筹算到珠算这一转变的完成。从这时起，珠算就成了主要的计算工具，古代的筹算就逐渐被人遗忘以至失传了。到后来，一般人只知有珠算，而不知有筹算，也不知道是由筹算演变而来的，这种情况一直继续到公元十八世纪中叶，在清朝学者们对古代数学深入研究之后，才开始了解到古代筹算演变为珠算的经过。